全基因组测序更好地跟踪结核病疫情比标准测试

一种新形式的基因测试导致结核病的细菌也可以在结核病传播和提供更好的信息更准确地跟踪结核病疫情比当前标准测试,根据德国的一项研究发表在本周的《公共科学图书馆·医学》杂志上。

博士带领的研究团队通过Stefan Niemann Forschungszentrum Borstel,分子Mycobacteriology,比较了两种类型的测试结果在86结核分枝杆菌分离株的结核病疫情在德国汉堡和石勒苏益格-荷尔斯泰因州在1997年至2010年之间,在研究期间,2301人患病。

他们发现新的测试(全基因组测序)提供更准确的信息集群和纵向病原体的传播比标准的测试(经典的基因)。重要的是,全基因组测序显示第一次爆发隔离错误地聚集了基因型和不属于最近的一个经典传动链。

利用全基因组测序,作者估计,结核分枝杆菌的遗传物质进化速度以每年0.4突变基因,这表明细菌生长在其自然宿主(感染者),22个小时的倍增时间,或每年400代。这一发现对结核分枝杆菌的进化从全基因组测序表明信息可以用来帮助跟踪未来爆发。

重要的是,全基因组测序费用的下降,这个测试将很快成为标准方法确定传输模式和传染病疫情。

作者说:“我们的研究表明,基因组sequencing-based打字提供流行病学相关解决大,纵向(结核分枝杆菌]暴发比古典音乐更有效得多基因分型。"

他们继续说:“我们设想,(全基因组测序)进步的有效实施将不断加速的测序成本,减少广泛分布的所谓台式基因组测序和即将到来的生物信息学的发展促进快速和相关解释结果数据的公共卫生和医疗环境。”

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