结核病暴发可以通过DNA追踪来“解决”

利用DNA测序重建结核病(TB)等致命疾病在人与人之间的传播，可以快速确定病原体的起源和移动。在华威大学普通微生物学会秋季会议上发言的一位科学家说，这种方法直接为控制传染病爆发的公共卫生策略提供了信息。

来自加拿大温哥华不列颠哥伦比亚省疾病控制中心的一个研究小组使用全基因组测序来分析细菌的DNA41名结核病感染者中36人的样本中爆发．他们能够追踪病原体在不列颠哥伦比亚省社区的移动，包括它从哪里开始，谁感染了谁。据此，他们可以确定促成疾病传播的关键人物、地点和行为。他们展示了社会结构导致了结核病的迅速传播，也导致了可卡因的增加可卡因的使用可能引发了病毒的爆发

早期的流行病学工具分析了感染样本中的部分(但不是全部)DNA。这提供的信息太少，无法准确地重建疫情，科学家只能对病原体如何在人群中传播做出有根据的猜测。首席研究员Jennifer Gardy博士在会议上发言说:“‘解决’疫情——确定疾病的来源和潜在的传播模式——是众所周知的流行病学圣杯。利用全基因组测序，我们现在能够像野外博物学家一样行动，并观察如何进行病原体在野外好好表现。我们可以看到疫情从哪里开始以及如何传播。这种水平的洞察力以前从未见过，它有望改变我们进行公共卫生疫情调查的方式。”

该小组目前正在将同样的重建技术应用于不同社会环境下的不同结核病爆发。Gardy博士解释说:“我们正在发现基于位置的传播是多么重要，识别和筛查去过这些地点的个人是疫情管理不可或缺的一部分。”其他研究小组正在将这种基于基因组的方法应用于其他微生物的爆发重建。“我们希望建立一个‘病原体知识库’，描述不同的传染病是如何在不同的社会和环境环境中传播的。由此，我们将能够确定可以在全球范围内针对的共性公共卫生干预。”

Gardy博士说，这项工作直接为公共卫生政策和实践提供了信息。“作为一线公共卫生从业者，我们正在使用全基因组测序来回答紧迫的问题。我们能够在短期内将我们的研究成果转化为临床行动。通过更好的控制和预防规划，我们最终可以减轻某些传染病的负担，”她说。

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