脑肿瘤中的聚集废物预测疾病严重程度
蛋白质对所有细胞过程都至关重要。所以一个细胞要保持活力,就必须保持蛋白质的形状。用专业术语来说,这被称为蛋白质折叠,它指的是蛋白质呈现其生物功能三维结构的过程。在较高的压力或温度下,蛋白质会迅速发生错误折叠,错误折叠的蛋白质失去其功能,甚至凝结成有害的聚集体。
因此,蛋白质不断调查蛋白质质量控制系统,或PQC。PQC可以折叠,再折叠,或在必要时,最终降解错误折叠的蛋白质。然而,蛋白质质量机制可能会被破坏,迫使细胞将有毒的蛋白质废料分类成一种叫做聚集体的类似垃圾箱的结构,它作为PQC的最后一道防线,当细胞应激减轻时最终被清除。
“癌细胞也不例外。由于它们高度活跃并迅速分裂,它们需要保持有毒废料埃及儿童癌症医院(CCHE)研究部主任Shahenda El-Naggar博士说。
El-Naggar是最近发表的最新手稿的相应作者《神经肿瘤学学会举办的报告在脉络膜丛肿瘤(CPTS)中改变了PQC活性,这是一种罕见的小儿脑肿瘤。在CCHE病理署归档的42个CPT组织后,她的团队已成功确定了百分比之间的相关性肿瘤细胞含有高血症和疾病严重程度。他们报告了超过25%的含量抗细胞的肿瘤是最具侵略性的,这可能影响治疗决定。
传统上,CPTS根据它们的组织学特征(它们如何在显微镜下看)分为三个亚组,而先进的分子分类将这种类型的肿瘤分成两个不同的亚组。有趣的是,所有侵袭性组织学和分子亚组含有尖锐等级。
在之前的一项研究中,该团队也使用了aggresomes来预测另一种侵袭性小儿脑癌髓母细胞瘤的预后。因此,这些结果验证了聚合体作为两种侵袭性儿童脑肿瘤分子预后工具的有效性。在目前的研究中,该团队决定进一步调查聚集体阳性cpt的改变途径。
“解开CPT中的主要改变的途径可以深化我们对疾病发病机制的低估;它也可能发现新的治疗目标,”纸上的第一个作者Nada Amer说。
该团队从肿瘤组织中提取了整个遗传物质(基因组)和整个表达的蛋白质。然后,他们进行了一项名为全基因组DNA甲基化分析的技术,该技术可以让人们了解良性和恶性肿瘤之间改变的通路。
DNA甲基化是一个正常的生物学过程,它通过在某些关键位置添加甲基基团和关闭某些基因来协调我们的基因活动。甲基化模式的任何异常改变都会破坏微调的基因组乐团。
该分析显示,在富含藻对阳性和侵蚀性分子类型的PQC活性相关的几种基因中揭示了改变的甲基化签名。当团队比较不同亚组之间的差异表达蛋白质时,这也很明显。
“最有趣的发现之一是ZIC系列转录因子成员在关键地点的高甲基化,”Amer说。她解释说,这些基因对脑细胞的正常发育至关重要,并且据报道它们被沉默于其他类型的侵袭性肿瘤。“总的来说,我们的数据支持该蛋白酶不仅是一个有价值的预后标志,而且还可以在未来为CPT治疗提供潜在的目标,”El-Naggar说。
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