大规模测序研究发现罕见的DNA改变与2型糖尿病有关
一个由科学家组成的国际联盟分析了近4.6万人的蛋白质编码基因,发现罕见的DNA改变与2型糖尿病有关。这项研究是同类研究中已知的规模最大的研究之一,包括来自欧洲、非洲裔美国人、西班牙裔/拉丁裔、东亚和南亚血统的人的数据。
从这个大的队列 - 大约21,000名以2型糖尿病通过对25000名健康人的控制,研究人员发现了四种影响糖尿病风险的罕见变异基因。数据表明,未来可能还会有数百个基因被鉴定出来。
这些基因和它们编码的蛋白质是潜在的目标新药物,并可能指导研究人员更好地了解和治疗疾病。
该团队的所有研究结果都可以通过2型糖尿病知识门户,使世界各地的科学家为自己的研究获取和使用这些信息。
密歇根大学公共卫生学院生物统计学教授和统计遗传学中心主任Michael Boehnke说:“这些结果证明了研究来自不同祖先的大样本个体的重要性。”“大多数大规模人口研究都集中在欧洲血统的个体上,因此很难在全球范围内推广结果。群体越多样化,科学就越好,也就越丰富。”
“我们现在对罕见的DNA变异在糖尿病中的作用有了最新的认识,”该研究的第一作者Jason Flannick说。“这些罕见的变异可能为药物开发提供比以前认为的更有价值的资源。我们实际上可以在许多基因中检测到疾病关联的证据,这些证据可以被新的药物靶向,或者被研究来理解疾病的基本过程。”Flannick是哈佛医学院的儿科助理教授,波士顿儿童医院遗传学和基因组学部bob电竞门的助理教授,也是麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所的副成员。
其他资深作者还包括牛津大学(University of Oxford)糖尿病医学教授马克•麦卡锡(Mark McCarthy)和麻省总医院(Massachusetts General Hospital)内分泌部和糖尿病科主任、哈佛医学院(Harvard Medical School)医学教授、布罗德研究所(Broad Institute)糖尿病研究小组主任何塞•弗洛雷斯(Jose Florez)。
这项研究发表在今天的自然。
是全球关注的问题
据世界卫生组织统计,全世界有超过4亿人患有糖尿病。这些病例绝大多数是2型。据估计,糖尿病是全球第七大死亡原因。虽然研究人员已经知道生活方式和环境因素在2型糖尿病中起着巨大的作用,但深入了解驱动该疾病的生物学机制是至关重要的。
在这项研究中,研究人员测序了所谓的“外显子组”,也就是说,只有基因组中编码蛋白质的区域。
另一种发现疾病相关变异的方法被称为全基因组关联研究(GWAS)。这种方法可以非常有效地在整个基因组中发现常见的疾病变异,但可能会漏掉不常见的外显子组变异。这是关键,因为虽然罕见的外显子组变异极其难以检测,但它们可以提供对疾病相关基因的宝贵见解,进而可以提示新的药物靶点。
因此,研究人员的目标是在未来的研究中增加样本尺寸。对于近50,000的群组,这可能是2型糖尿病的最大exome测序研究,但作为作者在纸纸中的状态,可能需要75,000和185,000例之间的样品尺寸来识别甚至那些罕见变异影响最大。
“记住这一点至关重要的是,因为我们在蛋白质编码DNA中检查变体,我们不会在检测到显着效果所需的样品数量上休息,”何塞弗洛斯说。“这些变化的影响可能是强大的,但由于它们是如此罕见,我们仍然需要增加样本大小,以便真正导出引人注目的见解。”
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