潜在的致命心脏异常的遗传测试可以在黑人美国人误诊病情
基因检测极大地改善了医生患有心脏骤停或突然心脏死亡的人们的无症状家庭成员中潜在的致死心脏异常的能力。
但哈佛医学院的一项研究于8月18日发布新英格兰医学杂志表明,在过去十年中,这些救生工具可能具有不成比例的误诊,一种心脏病肥大心肌病(HCM) - 黑人美国人。HCM影响500人中的一个人,是一种常见的心肌增厚,可以在看似健康的年轻成年人中引发致命的心律失常。
遗传测试可能误读良性遗传改变,因为疾病造成的突变并不完全是新的。但是,这项研究被认为是第一个在早期研究中追踪问题的根源,以定义某些常见的遗传变异作为HCM的原因。
实际上,分析表明,在HCM的情况下,假阳性诊断源于设计的临床研究中,这些临床研究主要用于白色群体作为对照组。白色美国人港口的几个基因涉及比黑人美国人的几个基因。后一组良性变化率较高可能导致测试结果研究人员说,被误认为异常。
使用统计模拟,HMS团队展示了甚至在原始研究中的少数黑色参与者将改善测试准确性,因此,帮助避免了一些假阳性诊断。
研究人员所说的调查结果突出了解释遗传测试结果对不同控制群体的重要性,以确保一个种族或族群中常见的遗传标记的正常变化不会被错误分类为另一个疾病导致疾病。
该团队表示,他们的调查结果指出,通过使用新的种族多样化的测序数据来重新评估数十年的遗传研究。
“我们认为,在肥厚性心肌病的情况下,我们看到的是冰山的尖端,其超越单一遗传疾病的较大问题,”研究首次作者Arjun Manrai,Ph.D.哈佛医学院的生物医学信息学系。“我们希望我们的研究能够在其他遗传条件下激发对这个问题的系统审查。”
除了遗传误诊可以接受个人和家庭的情绪损害,研究人员表示,他们的发现代表了一种警示故事,与遗传学家,临床医生和政策制定者相似具有广泛相关的故事。
“我们的学习有力地说明了种族和族裔多样性在研究中的重要性,”哈佛医学院生物医学信息系的研究和主席高级调查员扎克·科纳,博士。“种族和革新的包容性提高了临床试验的有效性和准确性,在此过程中可以更好地指导临床决策和最佳疗法的选择。这是精密药物的本质。”
在目前的研究中,该团队分析了超过8,000名储存在三个国家数据库中的DNA样本 - 国家卫生局部孟德尔exome测序项目,1000个基因组项目和人类基因组多样性项目。五种遗传变异 - 他们每个人均为75%遗传变异跨越人口。然而,团队发现,这五个突变发生在黑人美国人身上不成比例。2.9和27%的黑人美国人占了一个或多个这样的变种,而白色美国人的0.02%至2.9%。
接下来,研究人员在2004年至2014年间在领先的遗传实验室检查了超过2,000名患者和家庭成员的记录。七名患者接受了报告,表明他们患有疾病导致的疾病突变,随后被重新分类为良性。七名患者中的五个是黑色的,而且两个是未指明的血统。研究人员称,尚不清楚七名患者中有多少人重新接触以传达测试结果的变化。
调查人员小心,单一基因实验室的测试结果不一定是全国性问题的范围,而是表示他们的发现可能指出超出单一实验室和单一条件的差异。
为了追踪错误分类的根源,研究人员审查了五项原创研究,以形成遗传变异的早期了解及其在肥厚性心肌病发展中的作用。所有这些都是,研究人员发现,分析了小的人口尺寸,没有表明黑人被纳入对照组。
但是,调查人员增加,即使是小型研究也可以避免遗传变异的错误分类,只要它们包括种族多样化的人口。使用统计模拟,该团队表明,其中包括20名黑人参与者的200人的样本只有50%的机会正确地裁定有害突变。如果其中三分之一的患者是黑色的,则相同的样本将超过80%的准确性,如果其中一半是黑色的,则超过90%。
调查人员表示,新创建的Exome聚合财团 - 从各种大规模测序项目的汇编,其中包括来自60,000多个人的DNA - 即使相对而言,也能够在有害和良性突变之间辨别出来稀有遗传变异并应该有助于十年的旧数据的分析。
最新的临床指南敦促医生通过交叉引用对抗种族匹配的对照来解释遗传测试结果。然而,随着扩展来自各种民族和种族群体的DNA序列,研究人员表示,在未来十年中,更多的遗传变异将被重新分类。在这种迅速发展的知识的背景下解释测试结果的含义将为临床医生提出严重挑战。
HMS团队表示,解决问题的一种方法,可能是使用护理点风险计算器来帮助临床医生和遗传辅导员更精确地衡量给定的重要性遗传变体。这些风险计算器将使用包含统计概率,种族,种族和家族史的算法,以帮助来自真正致病性突变的筛选变异噪声。
“确保基因组医学使所有人都有利于所有人,所有人的所有人都不是一种道德迫切,不仅适用于科学家和临床医生,而且是因为政治和健康政策的力量,”Kohane说。
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