疾病基因数据库显示潜在的药物治疗
位于圣路易斯的华盛顿大学医学院的研究人员创建了一个大型在线数据库,将数千个与癌症和其他疾病相关的基因与针对这些基因的药物进行匹配。其中一些药物已获得美国食品和药物管理局的批准,而其他药物则处于临床试验阶段或刚刚进入药物研发阶段。
的数据库是由同卵双胞胎兄弟,奥比·格里菲斯博士和玛拉基·格里菲斯博士开发的,他们对将药物与基因既是科学研究,也是个人研究。17年前,就在他们高中毕业前几周,他们的母亲死于乳腺癌。
遗传学研究讲师马拉基·格里菲斯(Malachi Griffith)解释说:“我们希望创建一个用户友好的综合数据库,类似于疾病基因的谷歌搜索引擎。”“随着我们朝着个性化医疗的方向发展,人们很有兴趣了解药物是否可以针对特定患者或某些疾病(如乳腺癌或肺癌)的突变基因。但要找到这些信息并不容易。”
药物基因相互作用数据库的详细信息于10月13日在线报道自然方法.该数据库主要侧重于癌症基因,但也包括与阿尔茨海默病、心脏病、糖尿病和许多其他疾病有关的基因。格里菲思夫妇与圣路易斯华盛顿大学基因组研究所的一组科学家一起创建了这个数据库。
该数据库易于搜索,适合研究人员和医生科学家,他们想知道通过基因组测序或其他方法识别的疾病基因中的错误是否有可能成为现有的目标药物疗法。数据库中包含的其他基因可能是未来的重点药物开发努力是因为它们属于一类被认为有希望成为药物靶点的基因。
基因组研究所主任、资深作者理查德·k·威尔逊博士说:“开发数据库对格里菲思夫妇来说是一项热爱的劳动。“这一资源具有惊人的深度,对于致力于为患者设计更好治疗方案的研究人员来说将是无价的。”
威尔逊和他的同事们警告说,该数据库是用于研究目的的,并不推荐治疗方法。该数据库的主要目的是进一步开展临床研究,以更有效地治疗疾病。
“这个数据库让我们离这个目标更近了一步,”玛拉基·格里菲斯说。“这是一个非常丰富的资源,我们很高兴能把它提供给科学界。”
这个数据库花了几年时间开发,现在可以公开使用,而且是免费的。它包括超过14000种药物-基因相互作用,涉及2600个基因和6300种靶向这些基因的药物。另有6700个基因在数据库中,因为它们可能被未来的药物靶向。
在此之前,研究人员想知道是否疾病基因可以用药物进行靶向治疗只能在科学文献中逐个搜索,临床试验数据库或其他资料来源,其中一些资料无法公开或不易检索。此外,许多现有的数据库都有不同的识别基因和药物的方法,这是一种“语言”障碍,可以将确定的搜索变成一种详尽的练习。
格里菲斯兄弟是生物信息学方面的专家。生物信息学是一门融合生物学和计算机计算的科学领域,涉及分析大量数据。这对兄弟在被反复询问是否通过药物-基因相互作用数据库确定基因列表后,产生了建立药物-基因相互作用数据库的想法癌症基因组测序可以用现有的药物进行靶向。
医学研究助理教授奥比·格里菲斯(Obi Griffith)说:“这个问题不需要电脑巫师来回答。”“但在现实中,我们经常不得不编写特殊的软件来找出答案。现在,研究人员可以快速、轻松地自行搜索。”
新的数据库汇集了来自美国、加拿大、欧洲和亚洲15个公开数据库的信息。用户可以输入单个基因的名称或多个基因的列表来检索针对这些基因的药物。搜索提供了针对每个基因的药物名称,以及药物是抑制剂、抗体、疫苗还是其他类型的详细信息。搜索结果还会显示信息的来源,以便用户可以更深入地挖掘。
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