“疯狂的异质基因”

癌症肿瘤几乎永远不会共享完全相同的遗传突变,这一事实使科学努力更好地分类癌症类型并开发出更有针对性的有效治疗方法。

在9月15日发表的一篇论文中自然方法,加利福尼亚大学的研究人员,圣地亚哥提出了一种新方法,称为基于网络的分层(NBS),该方法不是通过单个患者的奇异突变来识别癌症的亚型,而是通过这些突变影响共享的。或系统。

“亚型是朝着个性化医学目标迈出的最基本步骤。”加州大学圣地亚哥加州大学圣地亚哥分校医学院遗传学部门的首席研究员特雷·艾德克(Trey Ideker)博士,圣地亚哥分校的医学和生物工程系教授。“根据患者数据,将患者置于带有相关疗法的亚型中。例如,众所周知,一种癌症的亚型对药物A的反应良好,而不是药物B。如果没有亚型,则每个患者从定义上看起来相同,并且您有不知道如何对待他们。”

知识和技术方面的最新进展使得对个体基因组进行测序,尤其是在癌症治疗方面变得更加容易(且价格便宜),这从根本上是一种基因疾病。

艾德克说,但是基因是“非常异构的”。受其他因素的影响,突变的基因会导致癌症等疾病。每个患者的癌症在遗传上都是独一无二的,这可能会影响临床治疗的功效和结果。

伊德克说:“当您查看患者的基因水平的数据时,每个人看起来都不同。”“但是当你看着影响时和系统,分组确实出现。没有基因在完全相同的位置突变,但是突变确实出现在相同的位置。”

具体来说,科学家们看了- 存在于肿瘤但不是健康的组织中 - 在肺,子宫和卵巢癌患者的数据中,由癌症基因组图集(Cancer Genome Atlas)(这是一项正在进行的国家卫生资助计划,旨在收集和分类成千上万的癌症患者的基因组。

艾德克说,NBS方法具有立即的临床价值。癌症患者的基因组测序正迅速成为诊断的标准部分。他说,临床医生可以使用NBS更好地匹配癌症亚型。通过记录治疗结果,将这些结果汇回数据库,它们可以进一步完善并改善癌症疗法,使其与个人本身一样个性化。


进一步探索

研究者确定基因变异,可以帮助预测癌症治疗反应

更多信息: 自然方法,,,,doi:10.1038/nmeth.2651
期刊信息: 自然方法

引用:“疯狂的异质基因”(2013年9月15日)2022年6月5日从//www.pyrotek-europe.com/news/2013-09-wildly-heteroceneous-genes.html检索
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