研究人员跟踪cocaine-driven结核病疫情的来源

(PhysOrg.com)——西蒙弗雷泽大学的研究人员首次把整个细菌基因组分析的最新技术和社交网络追踪调查的令人费解的起源在公元前社区结核病(TB)爆发。

学院微生物学教授领导的研究人员,菲奥娜Brinkman,曾与BC疾病控制中心(BCCDC)。他们应用最新的方法在基因测序分析获得的完整基因编码的地图结核细菌从受影响社区的36个患者基因组。他们还从前结核病疫情测序的细菌在该地区是否有突变。

尽管传统的DNA指纹图谱显示,细菌都是一样的基因型,完整的基因组分析发现了一个以前隐藏层遗传多样性——大约200个地点的基因组四百万个“字母”杰出彼此不同的样本。

研究人员又做了一个“家庭树”的两个结核菌株,显示相关的样本。结合这些信息与社会网络调查BCCDC已经收集了从感染者,他们可以通过社区确定每个结核菌株的路径。

”由于这种社交网络调查与基因组学的结合,我们第一次将结核病疫情与可卡因使用在一个社区内,“边缘主义者说。研究人员也能够识别一些被感染的人是“超级传播者”——给许多其他疾病。

“过去花费数百万美元用于这样一个完整的基因组序列,但现在它是更便宜,更像是数百美元,“边缘主义者说,他慷慨的资助从学院社区信托捐赠基金来开发这些计算机分析基因组序列的方法。她希望新的计算工具,她的团队正在开发将很快就能找到答案在几周或更少,导致更好的控制措施。

更多的信息关于边缘主义者的研究将会发表在新英格兰医学杂志》上2月24日。