识别子宫癌相关的基因网络可能会带来更好的治疗选择

子宫癌是女性中第四大常见癌症，在美国发病率呈上升趋势

这就是为什么克莱姆森大学的遗传学家艾莉森·希克曼的研究重点是识别神经网络基因参与子宫癌这可能是更有效的药物治疗的潜在目标。

美国癌症协会估计，美国有近6.6万名妇女接受了子宫癌癌症今年的诊断。到2022年，将有超过1.25万名女性死于乳腺癌。

利用公开可用的基因组数据库的数据，基于数学的分布算法和知识独立网络构建(KINC)软件，Hickman的教授Alex Feltus与克莱姆森校友、现任华盛顿州立大学助理教授Stephen Ficklin合作，建立了正常子宫组织和两种子宫癌亚型的条件特异性生物标志物系统子宫内膜癌最常见的类型是子宫癌肉瘤，子宫癌肉瘤更为罕见，具有侵袭性和致命性。

这些系统允许更全面地了解影响子宫癌的生物网络和途径，而不是在以前的研究中所做的单基因分析。

“我们正在寻找模式。在这项研究中，我们能够区分出在子宫癌中与正常子宫组织中有不同关系的基因，”希克曼说，她于去年12月在克莱姆森大学获得了遗传学博士学位。“最终的目标是更好地了解在生物上发生了什么细胞水平上在这些癌症中，它可以在未来带来更好的治疗。”

没有一个基因决定一个人是否会患上癌症。相反，它是一个复杂的基因系统。

希克曼的研究发现了11个与子宫癌相关的高优先级基因。这些基因是药物治疗的潜在目标。

“如果你知道什么是坏的，你就能修复它，”Feltus说，他是理学院遗传与生物化学系的教授。“在科学史上，我们现在第一次有能力审视整个系统，找到破碎的部分，然后开始修复它们。”

“这不是要找到一个基因的灵丹妙药，”Feltus继续说。“这是从治疗基因组的角度找到鸡尾酒。”

Feltus用蜘蛛网作为类比。如果你想摆脱蜘蛛网，你可以剪掉一根蜘蛛网，但它不太可能消失。但如果你在蜘蛛网上击中足够多的点，蜘蛛网就会崩溃。

希克曼和其他研究人员在该领域的工作很重要，因为科学家们可以看到批准用于其他类型癌症的治疗方法是否针对相同的“受损基因”。

“最终，这是真正的圣杯，如果我们知道病人的子宫癌中有x个破碎的基因，我们可以用小剂量的药物来调整这些基因，同时针对所有这些破碎的基因，而不是像我们现在拥有的许多抗癌药物那样，用一个巨大的毒药炸弹。”Feltus说。

“100年后，将会有药物与大多数基因相互作用，所以你将能够根据肿瘤的基因特征设计鸡尾酒，”他说。

希克曼首先从两个在线基因组信息公共数据库中收集数据:癌症基因组图谱和美国国立卫生研究院基因型组织表达(GTEx)项目。她使用高斯混合模型构建了子宫内膜癌、子宫癌肉瘤和正常子宫组织的条件特异性基因共表达网络。然后她成立了公司子宫监管优势和调查潜在的共同监管关系。

希克曼说，这种方法允许分析参与多种生物过程的基因，因此有多种表达模式。

一篇发表于G3-Genes基因组遗传学题为“鉴定子宫癌中特定条件的生物标志物系统”描述了希克曼的研究。该论文的其他作者是Yuqing Hang和Rini Pauly。