研究人员确定了导致乳腺癌转移的细胞相互作用

HSE大学的研究人员发现了在乳腺癌转移中起关键作用的基因。研究结果发表在杂志上《公共科学图书馆•综合》。

每个人体细胞都包含大量的分子: DNA、RNA、蛋白质等。其中一类相互作用的基本分子是microrna，以及它们的靶标基因和转录因子。小分子核糖核酸是小分子可以直接降低的浓度(表达)目标基因，而转录因子能够增加和减少microRNAs和基因的表达。在健康的细胞在美国，这种相互作用是正常运作所必需的，而在癌细胞中，某些相互作用被“破坏”，从而使肿瘤扩散并逃避治疗。

生物学院和生物技术专家Stepan Nersisyan和Alexander Tonevitsky与他们来自Lomonosov MSU的同事(Alexei Galatenko, Vladimir Galatenko)一起开发了一种算法，可以重建癌细胞中细胞间相互作用的网络。他们利用这个项目来检测导致乳腺癌转移的关键分子。

他们应用机器学习方法建立了一个建立microrna、靶标和转录因子相互作用网络的模型。该计划的一个关键特点是它能够整合不同的数据源，包括各种交互数据库和样本集中研究分子的表达谱(如在真实肿瘤中)。程序免费在线。

作者使用乳腺癌相互作用网络来检测对乳腺有贡献的最重要的分子癌症转移。反过来，转录因子E2F1被证明是许多标记基因的关键调控因子，它的表达帮助研究人员高精度地预测患者是否会发生转移。

“我们提出一种假说，即在已建立的网络中，最活跃的分子可以包含预后信息:如果在初始肿瘤出现后它们出现了问题，大量中断的相互作用可能会增加转移的可能性。”初步结果表明，这一假设得到了证实。此外，大部分已鉴定的预后基因被证明与单分子e2f1的活性直接相关，”HSE微生理系统国际实验室初级研究员Stepan Nersisyan指出。

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