新的、简化的基因检测有效地筛查遗传性癌症
研究人员开发了一种新的综合遗传/表观遗传DNA测序方案，称为MultiMMR，可以在一次测试中从结肠癌、子宫内膜癌和其他癌症的一小部分DNA样本中识别错配修复(MMR)缺陷的存在和原因。这种方法可以替代复杂的多步检测工作流程，还可以确定目前临床检测经常遗漏的MMR缺乏症的原因。他们的研究结果发表在分子诊断杂志．
MMR基因监测和修复正常细胞复制和重组中可能发生的错误。在一些遗传和获得性癌症中，一个或多个MMR基因是失活的。“MultiMMR的影响是广泛的。MMR缺乏的肿瘤对new反应良好癌症免疫疗法，”首席研究员Trevor J. Pugh博士解释道，他是多伦多大学医学生物物理系的;大学健康网络玛嘉烈公主癌症中心;安大略癌症研究所，多伦多，安省，加拿大。“确定一个人是否有遗传性MMR缺陷也可以让临床医生登记患者进行积极监测，采取降低风险的策略，并提供基因检测给亲属——可能会改善患者的预后。”
MMR缺乏症的标准临床测试可能不一致，需要多次测试和不同类型的专业知识，导致对患者的护理不理想。新一代测序检测已经越来越受欢迎，并正在临床实验室中使用。然而，他们并不能确定MMR缺乏症的所有遗传变异，并且通常需要额外的测试。
MultiMMR同时检测启动子甲基化、突变、拷贝数状态、拷贝中性杂合性损失和来自少量DNA的微卫星不稳定性。在这项研究中，研究人员对82例mmr相关的结直肠癌、子宫内膜癌和脑癌患者的142个样本(82个正常样本和60个肿瘤样本)进行了DNA测序。作为阳性对照，45例患者的结果与以前使用常规测定的临床试验进行了比较。他们还使用MultiMMR分析了一种商业上可用的DNA对照，其中包括11种难以用下一代测序检测的变体。
为了检测MMR缺陷的存在，MultiMMR启动子甲基化和微卫星不稳定性分析分别发现95%和97%与临床测试的一致性。在检测导致MMR缺陷的变异时，在24例病例中，有23例与临床检测结果相匹配。的测验在多次测序中鉴定了合成混合物中的所有11个突变，并在29例检测不完全或不确定的患者中鉴定了错配修复缺陷。该小组能够确定目前临床级联经常遗漏的MMR的原因。
“我们已经证明，MMR的存在和原因可以在一次测试中确定，从单一的DNA样本中，从而最大程度地利用可用组织，简化工作流程，并改善Lynch和相关遗传性癌症的综合报告，”主要作者、多伦多大学医学生物物理系理学硕士Leslie Oldfield评论道;以及加拿大安大略省多伦多大学卫生网玛格丽特公主癌症中心。
研究人员指出，目前的级联检测方案可能无法满足结直肠癌和子宫内膜癌患者对通用肿瘤检测日益增长的需求。许多下一代测序测试不会筛查微卫星不稳定例如，启动子甲基化和体细胞突变。
Oldfield女士补充说:“免疫治疗的资格通常取决于MMR状况，因此及时和可靠的检测很重要。”“MultiMMR简化了流程，区分了MMR缺陷的类型，缩短了周转时间，可以随着需求的增加而很好地扩展，并可以为临床医生提供重要信息，为患者管理和治疗决策提供信息。”
进一步探索
