开发和分析验证基于新一代测序的微卫星instabili

引用的文章描述了一个试验,临床相关的五天的周转时间,可以进行20 ng基因组DNA的批量大小多达40个样品在一个单一的运行。

分析性能对准确性、重现性、精密,以及控制样品性能,估计在一个广泛的FFPE多个解决pre-analytical组织学变化,样品和分析差异性。

肖恩·t·格伦博士从OmniSeq Inc .,布法罗,纽约14203年美国、个性化医疗中心,罗斯威尔公园综合癌症中心,布法罗,纽约,14263年美国和分子和细胞生物学系,罗斯威尔公园综合癌症中心,布法罗,纽约14263年,美国说,“微卫星不稳定性(MSI)是一个很好的描述现象的特点是改变长度短的DNA重复区域称为微卫星。”

放大后,每个微卫星片段分析色谱手动审查评估肿瘤和正常同一个病人的样本之间的差异来确定长度的差异,或所谓的不稳定,在每个微卫星。

尽管CRA和额占大多数的微卫星不稳定的肿瘤,微卫星不稳定已经在其他肿瘤发病率低,但实质性的。

因此,要求正常的DNA可以限制病人的数量可以有测试由于困难获得正常组织导致次优的周转时间或无法完成微卫星测试。

虽然有其他已发表的研究使用挥动测试来评估MSI地位和那些使用传统的片段分析没有匹配的正常,作者开发了第一个敏捷挥动平台,是临床实验室改进修改认证和纽约州临床实验室评估项目批准临床MSI检测患者使用下一代测序,可以利用所有实体肿瘤而不需要匹配的正常组织。

格伦研究团队总结道,“总的来说,我们已经开发出第一种NYS-CLEP批准,分析MSI检测要求的最小输入进行验证肿瘤DNA不需要匹配的正常组织学不可知论者。”