新型对准序列描述符在Zika病毒表征中的应用

最近南部和拉丁美洲的Zika病毒感染疫情对其对美洲人口的影响以及全世界病毒的分歧提出了严重的担忧。Zika病毒疾病是一种相对较新的现象，足以迄今为止迄今为止尚未提供足够的数据和调查报告。虽然1947年在乌干达的Zika森林动物中首次被公认为新病毒，但它对导致婴儿出生的人类胎儿的衰弱作用未知或良好地调查，直到2013年耶利尼西亚耶斯岛的耶和华岛的流行形式现在在2015 - 16年的南美国家。关切的是，在哥伦比亚，厄瓜多尔，萨尔瓦多和牙买加等一些国家的公共卫生当局要求他们的女性避免怀孕，直到病毒更好地理解。世界卫生组织（世卫组织）标志着爆发了这种异常作为国际问题的公共卫生紧急情况。

Zika病毒的病毒是由埃及伊蚊传播的，这种蚊子在热带气候地区很普遍，但随着全球变暖的趋势正在向北传播。为了了解病毒的性质，我们对非洲和非非洲(即亚洲、太平洋和美国)来源的病毒的完整RNA序列进行了特殊的生物信息学研究。我们知道，病毒序列的突变比哺乳动物的序列要快得多。我们发现非洲寨卡病毒序列与非非洲病毒序列明显分离。

从两张寨卡病毒基因组图可以明显看出这种差异，一张来自中非共和国，另一张来自巴西。这些图是通过我们的模型表示的寨卡病毒RNA序列，其中序列的核苷酸通过一套算法在二维网格上按顺序绘制。这种表示法使我们能够投射序列中核苷酸分布的视觉呈现，也可以通过数字序列描述符对序列进行定量索引，并测量序列之间的相似性和差异性序列。虽然通常的做法是使用各种比对技术，如BLAST、CLUSTALW等来测量这些差异，但我们的方法允许一种新的基因组表征方法，称为无比对测量，因此独立于几个假设。我们的研究结果使人们更加关注寨卡病毒的传播和突变，并希望有助于最终开发针对寨卡病毒特定基因表达或由这些基因表达的产品的合适药物和疫苗。

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