预测癌症的起源细胞

来自Brigham和女性医院的研究人员领导的一项研究表明，追踪癌症回到其细胞类型的新方法。通过利用路线图表观症式计划产生的外观蛋白酶映射 - 从100多种细胞类型中收集的数据资源 - 研究小组发现特定肿瘤的独特遗传景观可用于预测肿瘤的细胞类型的起源。这项研究，这一周出现在自然，为塑造癌症的早期事件提供新的见解，并且可能对癌症的起源位点未知的许多癌症患者具有重要意义。

“当人们计划路线图表述项目作为一种专注于正常细胞和组织的资源，没有人思考癌症突变并预测癌症的起源细胞 - 这不是任何人的雷达，”Co-Envisher Shamil Sunyaev，Phd说：a在Brigham和Women's医院的研究遗传学家。“我们的研究表明，我们现在可以预测，特别是针对不同的癌症类型，其中突变将在给定的癌症中发生，并且基于的原产癌的可能性是什么基因组序列。“

突变是癌症背后的驱动力，但它们在癌细胞的基因组上并不均匀分布。由来自广大麻省理工学院和哈佛大学和华盛顿大学的团队组成的研究人员假设“突变景观”的这种变化可能会受到影响染色质结构或者封装DNA的方式，从细胞类型到细胞类型中的速度广泛变化。

国家卫生院校普通基金的路线图表述表观委员会 - 一个项目，用于从各种组织类型和细胞类型中绘制染色质特征 - 给研究人员一种测试这一假设的手段。他们看着看看基因组序列如何癌细胞与不同正常的染色质结构相对应细胞类型，这对每个细胞类型具有高度特征。研究团队研究了各种癌症类型，包括骨髓瘤，结肠癌，脑癌等多种癌症类型的样本。他们发现的是意外的：癌症突变景观的变化与染色质结构非常强烈地绑定，因为细胞的染色质结构模式是如此独特，他们可以使用癌症的突变模式来预测它起源的可能的细胞类型。

大约两到5％癌症患者有癌症，其主要网站仍然未知。未知原代原产的癌症可能对治疗决策构成挑战，这些判决通常会影响或基于癌症的原产地。

“这项工作可能对治疗有影响 - 经常，我们遇到了与来自未知原主现场的转移性癌症的临床诊所，这使得选择正确的初始治疗方案非常困难，”联合长John Stamatoyannopoulos，MD，华盛顿大学基因组科学和医学教授，肿瘤科。“我们发现癌症的基因组序列中的突变模式是其始发细胞类型的强烈预测因子，因此可能有助于指导这种治疗决策，并且随着癌症基因组测序变得更加常规，可能会越来越可行。”

结合表观胸部资源和癌症基因组信息还可以使研究人员在癌症开发的早期时间内部洞察，该信息目前可获得较少的信息。了解染色质结构如何塑造癌细胞中突变的景观可以告知研究人员对首先引起的事件的理解癌症以及如何随着时间的推移而发展的。

“这为我们从未访问过的未经访问的未经访问的窗口提供了一个窗口，”Sunyaev表示，他也是哈佛医学院广泛研究所和教授的副教授。“我们现在可以利用这些突变模式中隐藏的数据 - 我们并不完全了解如何挖掘所有这些数据，但它可能持有更多信息，而不是我们已经解读了更多信息。”

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