独特的基因签名可以帮助预测化疗反应

弗朗西斯·克里克研究所的研究人员已经开发出一种方法,可以帮助预测肺癌患者对化疗反应,根据肿瘤的基因被开启。

近年来,癌症研究人员增加了我们理解特定的基因突变如何影响肿瘤的发展,如何发展和响应处理。然而,突变的存在并不能提供一个完整的肿瘤生物学。

在他们的研究发表在自然通讯本周,科学家们观察不同基因的表达在肿瘤,哪些是开启或关闭。

关注与RAS信号通路相关的基因,研究人员分析了数据集包含的信息在这些基因的活动癌症细胞。从这些数据集和人工智能的帮助下,他们编译一个独一无二的基因签名84年基因。

当科学家们回顾性研究数据来自500多个肺癌患者已经通过治疗,基因签名能够正确地预测哪些病人会和不可能从化疗中获益。

苏菲•德•卡恩位联席作者和博士后研究科学家克里克致癌基因生物学实验室,说:“与许多癌症治疗,和更多的药物试验,这是一个挑战,预测哪些治疗成功的机会最高为特定的病人。因为我们知道RAS信号参与各种耐药性机制,我们希望我们的基因签名将帮助定义组的患者可能受益于特定的疗法。

”与此同时,有很多的工作需要做,达到这一目标。它需要被测试在试验环境中,我们也希望它适应更容易部署。”

朱利安•向下位联席作者和致癌基因生物学实验室的主要组长克里克,说,“我们的工作表明,RAS信号通路是一个至关重要的因素在解释为什么肺癌化疗病人,有不同的反应。这个途径的基因表达水平比某些基因突变的存在更果断,包括KRAS基因的突变。”

菲利普·东、第一作者和生物信息学和生物统计学平台副主任克里克,补充说,“由于先进的计算工具,我们可以利用现有数据的大量癌症。这项研究表明这些数据集可能导致新见解,有可能改善患者的结果。”

研究人员将继续这项工作,包括研究它们的基因签名是否也可以用来预测哪些病人最有可能受益于免疫疗法。虽然这对肺癌基因签名进行优化,该方法可以用来制定其他癌症的签名。