基因组研究揭示不同人群与遗传性视网膜疾病

领导的一个国际研究团队,加州大学圣地亚哥分校的科学家们和加州大学圣地亚哥Shiley眼科研究所健康,扩大和加深了解遗传性视网膜营养不良(ird)影响不同群体的人,在这个过程中,发现了新的基因变异,可能会导致疾病。

研究结果发表在2021年10月18日的问题公共科学图书馆遗传学。

解码器是一组疾病,从色素性视网膜炎choroideremia,甚至导致进行性视力丧失,失明。每一只鸟是由至少一个引起的基因突变,虽然突变解码器在同一基因可能导致不同的诊断。

解码器是罕见的,但影响所有年龄段的人们,进展速度不同,即使在家庭患有相同疾病。具体的诊断取决于找到诱发基因突变。

美国食品和药物管理局已批准基因疗法治疗IRD涉及RPE65基因的一种形式,但是对于其他IRD在超过280种不同的基因突变造成的,没有治愈或治疗疾病进展缓慢。

研究人员进行了全基因组序列(WGS)从108年409人无关的家族血统,每一个都有以前诊断太少了。WGS完整是一个确定的过程,或near-entirety个体的DNA序列。它提供了一个全面的肖像的人的整个基因组,包括突变和变异,可以用于广泛的比较目的。

研究参与者是从三个不同的地理区域:墨西哥、巴基斯坦和欧洲的美国人生活在美国。基因组分析进行了从所有参与者的血液样本,显示致病变种62 108年的血统。共有94个基因变异被发现在62个家庭:52变异此前被认定为病因和42没有。令人惊讶的是,超过半数的新变异基因聚合数据库中没有列出,国际基因组数据的编译。

总的来说,墨西哥诱发变异被发现在63%的参与者中,60%的巴基斯坦,48%的欧洲的美国人。

研究还发现了一个大比例的新IRD诱发突变的人口研究和揭示了类型的突变导致遗传性视网膜营养不良。大约13%的家庭显示非典型或意想不到的基因组的变化。五个家族血统的突变在多个基因在所有受影响的个人;一个家庭在不同的基因进行突变影响的不同成员和新生突变被发现在一个病人没有出现在父母。

额外的8%的家庭有他们的基因组结构发生巨大变化,导致遗传性视网膜疾病和初步临床诊断四个家庭评审是基于他们的基因型。

作者说,新发现提高理解IRD诱发突变的分布在这三个不同的人口,这将进一步了解疾病的变异和演示。这反过来将有助于设计更高效的基因测试策略和治疗适用于全球人口。