社会经济差异和变异的引入解释了肯尼亚的COVID-19浪潮
结合抗体流行率、PCR检测结果、基因组监测和智能手机上的人口流动数据,传染病建模者能够解释自大流行开始以来影响肯尼亚的前三波COVID-19的演变。
华威大学和肯尼亚KEMRI-Wellcome信托基金会研究项目联合开展的模型将肯尼亚的COVID-19大流行解释为通过不同社会群体的连续传播波经济团体,随后是新变异的引入导致的感染。
这项研究已发表在《科学》杂志上,并获得了流行病防范和应对研究联合倡议的资助,这是威康与外交、联邦和发展办公室(FCDO)之间的合作,以及国家卫生研究所(NIHR)的资助。
预测COVID-19的未来传播需要了解过去的模式。研究小组使用了数学模型测试对肯尼亚前三波COVID-19疫情的解释。
这项工作由华威大学和肯尼亚KEMRI-Wellcome信托基金会研究计划的科学家联合开展,首次汇集了COVID-19抗体调查数据、PCR病例数据、基因组变异数据和谷歌流动性数据,试图找到肯尼亚COVID-19浪潮的解释。其目的是根据模型结果对该国未来的波动提供基于政策的预测。
在全球南方,由于居住在非正式定居点,较低的社会经济群体被确定为易受SARS-CoV-2影响的群体人口密度高卫生设施减少,以及对需要日常流动的非正式就业的依赖。相比之下,那些社会经济地位较高、有工作保障的人可以在家工作,保持距离,并随时获得水和卫生设施,从而减少传播。
模型的结果表明,肯尼亚国内高社会经济群体和低社会经济群体之间的流动性和接触率差异可以解释第一波和第二波感染。在疫情的初始阶段(从2020年3月开始),高社会经济群体的个人能够降低流动性和接触率,但低社会经济群体的个人则不能。这导致在较低社会经济群体中的个人之间传播,这被观察到是城市中心的第一波传播。随着这些人从感染中恢复,至少暂时具有了免疫力,第一波疫情结束了。
到第二波浪潮(从2020年10月开始)时,高社会经济群体的个人接触率和流动性都有所提高。这导致了高社会经济群体中的个人之间的传播,这被观察为第二波,此外,第二波涉及农村和城市地区。第二波流感似乎在个体清除病毒并至少暂时免疫后结束。然而,引入肯尼亚的新的Beta和Alpha变体更具传染性,并在高和低社会经济群体中引发了第三波疫情(从2021年3月开始)。
在许多其他非洲国家观察到的多波似乎不能完全用限制的时间来解释,而且由于它们在城市中心也有相似的社会经济群体,科学家们推测这些解释可能适用于更广泛的地区。了解这种多重浪潮的原因对于预测住院需求和包括疫苗接种策略在内的干预措施的可能有效性至关重要。
华威大学塞曼系统生物学和传染病流行病学研究所(SBIDER)和生命科学学院的Samuel Brand博士说:“这是第一批考虑详细预测2019冠状病毒病在撒哈拉以南非洲热带地区多波传播动态的研究之一。我们认为,这为可以在发展中国家实时开展的公共卫生建模工作树立了新标准。”
KEMRI-Wellcome信托基金研究项目的John Ojal博士说:“在高收入国家有关于这种性质的非常详细的建模研究,但在热带撒哈拉以南非洲之前还没有。”
华威大学塞曼研究所所长马特·基林教授说:“对高收入国家的研究发现,人口均匀混合的假设可以很好地解释新冠病毒在这些国家的传播。显然,我们对肯尼亚的研究并不总是如此,在其他低收入环境中,不同社会经济群体的传播差异可能会普遍存在。”
凯姆瑞-威康信托基金会研究项目内罗毕中心主任Edwine Barasa教授说:“我对肯尼亚社会经济群体传播的显著差异的发现并不感到惊讶,在肯尼亚,有很高比例的城市人口在非正规部门工作,他们没有机会减少接触,但需要每天找工作。”
更多信息:Samuel P. C. Brand等人,肯尼亚疫情浪潮背后的COVID-19传播动态,科学(2021)。DOI: 10.1126 / science.abk0414