自动计算机程序精确地计数细胞中的微核
微核是细胞内的小核样结构,通常与肿瘤有关。现在,来自日本筑波的研究人员开发了一种自动化的计算机程序,可以准确和重复地从显微镜图像中计算这些结构,这将提高微核研究的速度和准确性。
在最近发表的一项研究中,筑波大学的研究人员报告了他们新的基于matlab的程序,名为CAMDi(计算自动微核区分),可以从染色细胞的图像中自动计数微核。微核可以像普通核一样被染色,但它们与核的区别在于它们的大小要小得多。然而,识别它们说起来容易做起来难,因为计算微核的自动系统传统上只使用从单一层次的组织中获取的图像。为了理解为什么这很重要,想象一下在空间中固定一个球的横截面。如果你在靠近球顶部或底部的区域切下一片,那么截截面的大小会比你选择靠近中心的部分小得多——因此,靠近原子核外围的截截面很容易被误认为是微核。
为了解决这个问题,筑波大学的研究人员通过细胞或组织拍摄了不同层次的照片,并创建了一个能够分析所得到的三维信息的程序。通过这种方式,他们确保了该项目所计算的微核实际上就是微核。然后,他们用这个程序来观察小鼠神经元中的微核,并测试神经炎症对微核数量的影响。
“据报道,炎症和微核之间存在联系癌症细胞该研究的通讯作者Fuminori Tsuruta博士说。“我们决定测试大脑中的神经炎症是否会影响神经元中的微核数量。”
为了做到这一点,研究人员首先将炎症因子引入培养的小鼠神经元中,但他们使用CAMDi程序没有发现微核数量的变化。然而,当他们给小鼠注射脂多糖时,导致炎症细胞在被激活的海马区,海马神经元的微核数量增加。
Tsuruta博士解释说:“这些结果令人惊讶。“他们认为,神经元中微核的形成是由附近的炎症反应诱导的细胞."
鉴于微核是一系列病理的标志,这种新型计算机的发展程序对病理诊断和治疗反应的追踪非常重要。对微核的研究,以更好地了解它们的形成和在疾病中的作用,也将通过CAMDi的使用得到加强。
更多信息:Sarasa Yano等人,基于matlab的微核三维定量分析程序揭示了神经炎症诱导大脑中微核的形成,科学报告(2021)。DOI: 10.1038 / s41598 - 021 - 97640 - 6