探索深入到肿瘤组织

今天,像100年前那样,医生诊断患者的癌症通过组织样本,他们通常在福尔马林固定的显微镜检查。在过去的20年中,遗传方法也被证实可以更详细地描述肿瘤的突变,从而帮助临床医生选择最好的治疗策略。

甚至微小组织样本可以用来检测蛋白质

现在,一组研究人员从柏林马克斯·德尔布吕克分子医学中心的亥姆霍兹联合会(MDC)柏林健康研究所(波黑),柏林夏洛——夏洛蒂和德国癌症协会(DKTK)已经成功地详细分析超过8000蛋白在肺癌组织的固定样本使用质谱仪。

“我们已经开发出使用的方法,它已成为可能的分子过程进行深入分析癌症细胞在蛋白质水平在存档的患者样本中收集和储存大量在日常临床实践中,“菲利普博士说Mertins,蛋白质组学平台的负责人MDC和波黑。“即使是很小的组织样本,如前列腺穿刺活检获得的,是满足我们的实验。”

这项研究发表在《华尔街日报》自然通讯,被认为是一个主要的成功多模式临床质谱抗治疗目标(mstar)的研究项目,已由德国联邦教育和研究(BMBF)自2020年以来共计大约€570万。

Mertins和教授领导的研究小组,弗雷德里克Klauschen病理学研究所的查利特,已经能够表明proteins-unlike经常研究还相当敏感RNA molecules-remain多年稳定的样品,可以精确地量化。“此外,存在于肿瘤组织的蛋白质地图疾病进展非常好,”第一作者科琳娜弗里德里希说,实验室的博士生Mertins Klauschen。“这是因为他们提供诸如信息促进或抑制肿瘤生长的基因在细胞尤其活跃。”

承诺帮助识别的方法为每个肿瘤最好的治疗方法

这张照片获得团队的两种形式的肺cancer-adenocarcinomas和分析鳞状细胞癌——也变得如此详细,因为研究人员不仅发现了很多的蛋白质存在于细胞,但也超过14000 phosphosites量化。磷酸化的帮助下,一个机制,调节磷酸基的蛋白质的可逆的依恋,细胞控制几乎所有的生物过程通过切换或关闭某些信号通路。

“我们的论文因此获得更好的理解提供了一个良好的基础疾病进展在肺癌和其他类型的癌症,”Klauschen说,随着Mertins,是这项研究的共同通讯作者。Klauschen已经成为病理研究所主任Ludwig-Maximilians-Universitat慕尼黑,但在查利特继续进行研究。“我们已经开发出的方法还将使我们在未来更好地解释为什么对一些病人来说一个非常具体的疗法,但不是为别人,”增加了病理学家。他说,这将使它更容易,为每个病人找到最好的治疗方案。

方法也适用于研究心血管疾病

Mertins也希望大规模蛋白质组的光谱分析组织样本将为新生物标志物的发现不仅对治疗决策和病人生存的预测,而且其他分子结构,可以作为未来药物的目标。

根据研究员,有另一个+新方法:“我们的方法不仅适用于研究癌症,但也可以应用非常广泛。”For example, the Proteomics Platform has already successfully analyzed the proteome of fixed immune cells from COVID-19 patients. The authors have also provided guidelines on which mass spectrometric methods are best suited for different types of clinical studies.

议程上的下一个MDC平台质量光谱分析的额外固定免疫细胞以及固定心血管组织蛋白质和phosphosites的存在。“这里的目的是为了更好地理解传染病和心血管疾病、“Mertins解释道,“这一天有可能更好的方式来治疗这些疾病比迄今为止。”