自动化的新一代测序平台可以为COVID-19准确筛选数以千计

多伦多一个机器人平台设计的研究人员筛选数以千计的COVID-19样品一次有可能彻底改变实验室如何跟踪病毒和其他病原体的传播,根据新的发现。

这项研究,在周三自然通讯发现,下一代超-高通量测序平台,叫做C19-SPAR-Seq,设计人员从西奈Lunenfeld-Tanenbaum研究所(LTRI)健康,敏感率大于95%,阳性病例发病高峰。

“确定积极的样品快速、准确地击败这次大流行至关重要,”杰夫Wrana博士说,LTRI的资深研究员和教授的分子遗传学多伦多大学。“新的和有潜在危险的变体现在循环,这是一个可扩展的平台,自动化,能够分析成千上万的COVID-19患者样本在一个单一的工具。”

Wrana博士和其他LTRI高级研究员劳伦斯·佩尔蒂埃,与多伦多大学教授本布兰考,信贷的强大的团队希望学员从其他领域的研究转向帮助开发和验证平台,允许团队从概念到发表论文在12个月。

“西奈山医院临床诊断实验室的合作是我们成功的另一个关键因素,”Pelletier说。“迄今为止共享微生物学实验室,由托尼•Mazzulli博士提供了成千上万的标本。”

在2020年末,球队再次转动的使用机器人平台快速筛选数以千计的阳性样本变异的病毒基因组的测序指纹区域寻找关键突变。

“这是一个绝对的快乐与LTRI杰夫Wrana博士和他的团队,“Mazzulli博士说,microbiologist-in-chief西奈健康和大学健康网络(UHN)。”他的小说SPAR-Seq系统是尖端技术和他的团队的能力序列实时COVID-19样本有着巨大的潜力影响我们对小说的流行病学和传播突变体的理解。”

的平台也是划算的。这项研究指出它只花费8美元每个测试运行成千上万的样品时,成本样本减少由于规模经济。

“这是非常可靠和容易适应,”埃尔南德斯说,初级研究员和Drs Wrana实验室共同研究。Marie-Ming Aynaud Seda Barutcu。“周转大约24小时。很简单,我们几乎自动化过程的每一步。对我来说,这是一个非常激动人心的事我的工作改变。”