研究人员利用基因组学重建在圣保罗黄热病疫情
黄热病病毒通常局限于亚马逊地区,但是病毒传播在巴西东南部2016年到2018年之间,导致最严重的流行病和家畜流行病爆发了数十年之久。卫生部在人类和2251例黄热病确诊1567例猴子在巴西2016年12月至2019年6月。
根据一项研究发表在杂志上PLOS病原体三个流行/动物流行病的波,发生在这一时期在圣保罗,在东南地区人口最多的,是由不同血统的病毒引起的。在第一波(2016年7月- 2017年1月),病毒从北方进入状态,可能来自邻近的州米纳斯吉拉斯,和传播主要发生在城市,如圣荷西做力拓Preto和小溪Preto。第二波(February-June 2017)更强烈,洗了米纳斯吉拉斯边界的区域少de卡尔达斯到坎。最多的情况下通知在第三次浪潮(2017年7月- 2018年2月)。达到圣保罗城市后,病毒传播南Ribeira河谷地区,在那里发现了疫苗接种覆盖率和较低的人口稠密的城市成为一个主要公共卫生问题。
这些研究结果,发表在《华尔街日报》的一个国际研究小组FAPESP,必须占州政府支持的基础上基因组分析51病毒分离提取来自受灾地区的蚊子收集和猴子死于这种疾病。流行病学监测中心发送的材料(CVE) -圣保罗国务院的机构更阿道夫•鲁茨研究所(请愿,在圣保罗公共卫生的中心实验室。
“基于地理和时间分布的情况下非人灵长类动物,在系统发育分析(研究突变病毒基因组导致phylogeographical分析小说的出现血统]和[研究过程,确定不同血统的地理分布),可以确定当病毒进入圣保罗州,速度和传播方式,和所有方面的循环,”研究员雷纳托de Souza请愿,文章的主要作者之一,告诉FAPESP,必须占州政府通讯社的记者
这种层次的细节描述的流行病可能只是由于使用的奴才基因测序技术,Souza解释道。平台是便携、快速、廉价,允许实时监控的情况下在它们发生的位置。
该战略在2016年首次在巴西使用跟踪zika病毒在美国的运动。最近它帮助Brazil-UK虫媒病毒中心研究人员发现、诊断、基因组学和流行病学(CADDE)的进步跟踪COVID-19在巴西。这个项目是由酯落羽杉,圣保罗大学的研究员和努诺·法利在英国牛津大学,和由FAPESP,必须占州政府支持英国医学研究理事会和牛顿基金。bob88体育平台登录
偶然的主机
黄热病病毒循环永久在亚马逊地区,偶尔遇到有利条件,让它逃脱。Souza解释说,要实现这一目标向量蚊子的人口必须接触到人口密集的野生灵长类动物足以维持一段时间传播链。
“这不是永久性扩张,”他说。“病毒最终失去了流通环境的能力有关,并返回只有重新引入。在2016年至2018年之间,流通面积扩展到前所未有的程度。病毒传播的条件是正确的。它感染了野生灵长类动物Serra da Mantiqueira(圣保罗州的森林区域)和达成区域附近的大型动物园圣保罗市郊的城市。这可能发生在几年内,只要有足够的数量的增长灵长类动物在这些地方。”
流行病学说,有一个森林型黄热病暴发期间,苏扎说。虽然在人类中有很多情况下,仅仅发生在传播城市环境通过树栖蚊子Haemagogus和Sabethes等。
“在这种情况下,人类接触是偶然的。越来越多的人类自然环境的渗透和森林是因素之一,”他补充说,如果一个城市通过埃及伊蚊传播链已建立,这种疾病的发病率会更大,达到登革热暴发的水平。
”问题是森林型传动结构日益接近城市地区,加剧的风险介绍病毒进入城市的背景下,“他说。
跟踪病原体在猴子的数量的循环已经被认为是一个有效的流行病学监测策略,因为它有助于早期识别高危地区和规划控制策略,如疫苗接种运动。
“监控策略完全基于人类病例的监测检测只有20%的感染,症状的比例,所以漏报永远是重要的。在猴子中,出现症状有物种的90%,死于这种疾病。这些动物识别疾病监测病毒开始蔓延并及时实施作战计划,”苏扎说。
