基因研究显示COVID-19和SARS病毒的异同

研究人员已经确定了具体的部分COVID-19和SARS病毒的遗传编码,可以促进病毒的生命周期。这项新技术是研究人员的第一工具确定基因序列存储为rna dna的化学也更稳定。

“当前流感大流行是非常严重,我们要为全球加速冠状病毒的研究。我们的研究包括许多类型的病毒,但我们决定专注于冠状病毒的结果,”教授说Nobuyoshi Akimitsu,领导的研究小组进行的工作和一个专家在东京大学的细胞如何承受压力同位素科学中心。

许多家庭的viruses-including流感病毒和coronaviruses-store RNA基因序列,在不知不觉中进入人类细胞和技巧使更多的病毒。需要他们的RNA病毒保持稳定,从宿主的免疫系统抵抗努力降低他们的RNA。

该研究小组命名他们的技术Fate-seq因为它旨在确定一个基因序列的命运,是否会持续或降低基于其稳定性。

“Fate-seq技术是一个非常简单的想法。我们以一种新的方式结合现有技术,”Akimitsu解释道。

执行Fate-seq,研究者首先基因组切成短片段。甚至非常危险的病原体成为无害的研究人员使用短,分开,切好的片段基因组。

研究者合成RNA病毒基因组片段的检查他们的命运,这是稳定,通过使用下一代测序,研究人员可以快速、同时识别个人的确切顺序链RNA。计算机程序可以识别模式或有趣的基因序列的差异进一步详细地研究。

研究人员研究了11848年从26病毒基因组RNA序列,包括冠状,导致非典的病毒,突然急性呼吸系统综合症,在2003年上半年,造成774人死亡。研究人员发现625稳定的RNA片段。在稳定的RNA片段,21岁来自冠。

研究者比较了21冠稳定基因组片段基因序列数据用于其他类型的冠状病毒。稳定的两个片段冠是非常普遍的在其他类似的冠状病毒进化,包括病毒导致COVID-19 SARS-CoV-2。

预测模型表明,这两个稳定的RNA片段可能形成stem-and-loop结构。Stem-and-loops RNA的短片段,而不是保持一条直线,向前折叠和绑定到自己,形成了一个发夹的形状。

最值得注意的是,一个稳定的碎片中只形成一个stem-and-loop COVID-19病毒,不是SARS病毒由于一些病毒RNA编码的一些细微但重要的不同之处。

“stem-and-loop这个SARS-CoV-2基因片段的结构在计算机模型非常稳定,我们建议这个结构可能增强的生存病毒,”Akimitsu说。

除了更好地了解危险的病毒,研究人员希望利用Fate-seq了解RNA稳定的基本规则,推进医学新类型。人类细胞使用RNA作为中间DNA和蛋白质之间的信使。设计RNA-based药物对细胞稳定、容易转化为蛋白质可以治疗遗传疾病而改变我们的DNA的危害。

本研究进行了筑波大学的合作者和同行评议的杂志出版生物化学和生物物理研究通信。

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