新的COVID-19研究论文将其与SARS病毒相提并论

伍斯特理工学院(WPI)的生物信息学研究员德米特里·科尔金(Dmitry Korkin)创建了新型冠状病毒的3d结构路线图并与全球科学界分享了两个月后，在领先的病毒学杂志《病毒》上发表了一篇关于该主题的论文。

在同行评议的论文中，WPI计算机科学副教授、该大学生物信息学和计算生物学项目主任Korkin描述了他和他的研究生研究团队如何使用生物信息学和分子建模来重建主要病毒蛋白质的三维结构及其与人类蛋白质的相互作用。

具体来说，该团队发现了三种与COVID-19类似的严重急性呼吸综合征(SARS)分离物或样本，COVID-19是一种由一种从未在人类身上见过的新型冠状病毒引起的新疾病。非典,病毒2003年确定的，也造成了全球范围内的感染和大量死亡。

Korkin和他的团队得出了三个初步结论，可以在病毒建模和帮助科学家未来发现药物方面发挥作用。首先，他们确定，与人类SARS病毒和其他相关动物病毒相比，构成新型冠状病毒的蛋白质变化并不均匀分布，但往往在蛋白质表面形成集群。

其次，他的研究小组发现，新病毒表面的“刺突蛋白”(spike protein)区域与SARS中的同一区域有很大不同，这表明现有的SARS疫苗可能无效，需要一种新的疫苗。刺突蛋白是一种新病毒表面的蛋白质，可以被人类抗体靶向。

与此同时，该团队得出的第三个结论是，先前开发的SARS抗病毒候选药物针对的区域非常完整，这表明重新利用这些药物是可能的。

Korkin在每月在线出版的开放获取期刊《病毒》上写道:“这项计算工作的目标是双重的。”他说，他希望“……将结构路线图和相关发现完全提供给欧盟。研究社区以及“……帮助实验科学家破译与新型冠状病毒感染有关的分子机制，以及疫苗开发和抗病毒药物的发现。”

在美国，截至4月中旬，疾病控制和预防中心报告了近58万例COVID-19病例，超过2.2万人死亡。根据世界卫生组织的数据，病例数量已达数百万，导致全球超过10万人死亡。

今年2月，科尔金和他的研究团队创建并公布了新型冠状病毒的3d结构路线图。当时，科尔金与全世界的研究人员分享了这一路线图，以促进对这种疾病的更多研究。

为了让研究结果迅速传播到研究界，Korkin完整的3d结构路线图数据集和手稿预印本于2月14日发布在bioRxiv上，bioRxiv是一个免费的在线存档和分发服务，用于生命科学中未发表的预印本，由非营利研究和教育机构冷泉港实验室运营。

Korkin很高兴在《病毒》杂志上发表了这篇文章，并指出这证实了他之前的工作。

Korkin说:“在《病毒》杂志上发表的这篇文章加强了我们的希望，即我们团队在过去三个月里开展的工作将为研究界在共同抗击这种疾病的努力中增加重大价值。”“我们很高兴我们的工作得到了正式审查，任何人都可以作为开放获取的出版物阅读。”

与Korkin一起参与研究的有WPI的博士生崔洪珠、高紫阳、刘明、卢森宝，他们都来自中国;来自乌克兰的Oleksandr Narykov;来自印度的苏哈斯·斯里尼瓦桑;中国硕士生孙默;以及马拉维的富布赖特硕士学者温妮·Mkandawire。