科学家链接2国家爆发的基因指纹
美国科学家正在帮助公共卫生当局了解和跟踪冠状病毒,出现线索如何到达并传遍华盛顿州和超越,包括潜在播种爆发大公主游轮。
华盛顿州长禁止大型公共事件周三在三个县,一个策略指导下的特雷弗•贝德福德和他的同事估计目前有1100活跃情况下的状态,其中大部分是未发现的通过测试。
像一个侦探研究指纹,贝德福德使用遗传密码病毒留下。他连接的点突变病毒的基因字母表,30000 -字母字符串,变化的速度一个字母每15天。
那些微小的突变不改变病毒的影响的人,但他们确实让科学家得出结论如何在人与人之间传播。
后一个人与鼻腔和咽喉拭子检测病毒,一个小的标本可以用来快速病毒的基因组序列。工作已经发生,而不只是在西雅图,但在世界各地的其他实验室。科学家们分享他们的结果在一个公共平台,自2008年以来他们一直分享流感基因组数据。
本周,贝德福德的实验室与加州弗雷德哈钦森癌症研究中心研究人员发现一个集群之间的联系的情况下在西雅图地区和大公主游轮上的爆发在加州。
“他们都是非常相似的基因,”贝德福德告诉美联社。“似乎很有可能”,病毒从华盛顿爆发了大公主。
查尔斯·邱博士在加州大学,旧金山同意了。他提供了基因组测序7个样本感染乘客下了大公主。八分之一样品从早期大公主游轮到墨西哥与华盛顿州,邱说,那个人可能爆发播种在船上乘客的船离开夏威夷。
邱说,“最简单的解释,是大公主早些时候乘客已经在华盛顿州,然后播种游轮的爆发。
有另一种解释,赵说。邮轮旅客或机组人员被感染在另一个国家,巧合的是由病毒与华盛顿州的突变情况。
“常识告诉你更有可能来自华盛顿,”赵说。
对于大多数人来说,冠状病毒只造成轻度或中度症状,如发烧和咳嗽。对一些人来说,尤其是老年人和人民与现有健康问题,它会导致更严重的疾病,包括肺炎。绝大多数人在几周内恢复。
基于基因组测序18华盛顿州的情况下,贝德福德认为国家爆发开始于一个人,也许这位35岁的美国男人是第一个已知的情况。的冠状病毒感染率在西雅图流感研究中,一个项目映射季节性流感,表明可能有1100活跃COVID-19感染状态,尽管由于建模的局限性,数量可能从低至210高达2800活跃的感染。
卫生当局试图跟踪所有美国人接触第一个案例中,一位居民Snohomish县,北西雅图,曾去过武汉,中国城市的初始中心的爆发。他降落在在1月15日——塔科马国际机场,开始感觉生病的第二天。在1月19日,他参观了一个诊所,1月20日入院。
“他们非常积极的接触者追踪识别的人有过接触,最初病例和向外的同心圆,”南希Messonnier博士的疾病控制和预防中心周三说。她叫贝德福德的工作”一个有趣的假设,”但他说爆发可能是造成“二次播种。”
克里斯蒂安·安德森,一个遗传流行病学家拉霍亚的斯克里普斯研究中心,加利福尼亚,一致认为,该病毒由一个人介绍给华盛顿州,建议主动情况下可能超过1100。结论贝德福德描述都不是一个惊喜,他在一封电子邮件中说。
“美国完全没有准备pandemic-despite有足够的时间我们目前最低的国家之一COVID-19能力测试,”他写道。“这仍然是一个巨大的问题,很有可能我们目前失踪全国绝大多数情况下发生。”
“除非我们检测情况下转换的能力在几天内和侵略性的策略反应,几周内,我们会发现自己处在这样的情况非常类似于一个目前在意大利展开,”安德森写道。
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