了解肠道细菌的力量是好的(有时是坏的)
早在2015年,一个跨学科的研究科学家小组在一次商业宣传比赛中提出了他们的观点:他们想创建一种基于订阅的服务,就像23andMe一样,人们可以通过它发送样本进行详细分析。研究人员将使用快速算法快速处理这些大数据,并向消费者发送详细的报告。
但该团队并没有通过脸颊拭子进行血统检测,而是试图确定个体肠道内存在的大量不同细菌物种,最终目的是改善公众健康。
Hiroki Morizono博士是该团队的成员,他贡献了关于拟杆菌的详细知识,拟杆菌是与人类共存的各种细菌物种中的一种关键生物,生活在我们的肠道内。这些共生菌把我们所吃的食物转化成能确保它们和我们的健康的元素。
“数万亿细菌活在内心深处。拟杆菌是主要的细菌种类之一,”华盛顿特区儿童国家遗传医学研究中心的首席研究员Morizono说“在我们的直觉里,他们通常是好公民。但如果它们进入我们的血液,就会变成邪恶;他们在错误的地方。如果你感染了拟杆菌,死亡率是19%,而且它们对大多数抗生素治疗都有抗药性。”
这是他们项目的起点,也是更好地描述肠道细菌和细菌之间关系的第一步人类疾病-正在对居住在那里的细菌进行精确的普查。
在2019年9月11日发表的一篇论文中《公共科学图书馆•综合》由乔治华盛顿大学(George Washington University)教师领导的多机构研究团队就这样做了,他们在健康志愿者的肠道内发现了157种不同类型的生物(8门,18纲,23目,38科,59属,109种)。
研究参与者是通过在华盛顿大学雾底校区的传单和电子邮件招募的。他们记下了自己每天吃的和喝的东西,包括品牌、类型和份量。他们通过提供粪便样本来补充食物日志,从中提取DNA。从人类微生物组项目第一阶段研究中随机选择的50个粪便宏基因组样本用于比较。
“肠道微生物群本身就非常非常酷。在收集这些数据的过程中,我们正在建立一个知识库。在这篇论文中,我们说的是,通过观察健康的人,我们应该能够建立一个正常、健康的肠道微生物群应该是什么样子的基线,以及在不同条件下情况会如何变化,”Morizono补充道。
他们为他们的细菌丰度档案选择了一个非常非常酷的名字:GutFeelingKB。
KB是知识库。我们的想法,是一种直觉。这是个糟糕的笑话,”他承认。“果蝇研究人员为他们的基因取了最好的名字。没有其他生物群体可以与之竞争。至少,我们努力了。”
接下来,研究小组将继续收集样本,建立细菌基线,将其与临床数据联系起来,然后开始研究对患者的健康影响。
“我们可以用它来了解抗生素治疗后肠道中的细菌种群是如何变化的。这就像看着森林在大火后重新生长一样。”“有了益生菌,我们能做些什么来鼓励正确的细菌生长吗?”
更多信息:查尔斯·h·金等人,健康人肠道菌群基线概况和标准报告模板,《公共科学图书馆•综合》(2019)。Journals.plos.org/plosone/arti…journal.pone.0206484