追踪艾滋病毒不断进化的基因组，努力优先考虑公共卫生资源
美国的每个县都在追踪艾滋病毒病例，对病毒的基因组进行测序，看看它是否对目前的药物有耐药性，并寻找趋势。最近，当地卫生部门和疾病控制与预防中心(CDC)已经开始使用这些HIV基因序列来追踪病毒的传播历史。
他们能这样做是因为病毒进化迅速，基因变异频繁出现。这些信息使研究人员和公共卫生官员得以建立传输网络，艾滋病病毒基因相似的人群。传播网络有助于确定哪些人群传播艾滋病毒的风险可能增加，但它们无法揭示谁从谁那里感染了艾滋病毒。
加州大学圣地亚哥分校医学院的研究人员最近与洛杉矶县公共卫生部合作，利用这些数据来寻找该地区的艾滋病毒感染趋势。他们希望发现许多与男性发生性行为的男性之间的传播群集，这一群体占美国每年新增艾滋病毒病例的62%，但他们惊讶地发现，这些群集中有更多的跨性别女性(出生时为男性，但自认为为女性)和异性恋男性(出生时为男性，自认为为男性)，这比他们预期的要多。
该研究结果发表于2019年2月11日柳叶刀艾滋病毒，暗示跨性别女性的地位更高的风险艾滋病毒传播网络的风险比男男性行为的风险更大。此外，这些群体中的顺性男性感染艾滋病毒的风险应该比以前认为的要高。
“这是一种我们以前不知道的艾滋病毒传播模式，这些信息可以帮助我们减缓病毒的传播，”加州大学圣地亚哥分校医学院传染病和全球公共卫生学部助理教授、资深作者乔尔·韦特海姆博士说。“例如，这类信息可能会有所帮助公共卫生官员调整他们的努力变性人群体希望他们能够诊断艾滋病毒感染者，让更多被诊断的人得到他们所需的护理，并帮助高危人群获得预防药物。”
Wertheim和第一作者Manon Ragonnet-Cronin博士一起领导了这项研究，Manon Ragonnet-Cronin博士在研究时是他团队的博士后研究员。
在洛杉矶县，跨性别女性占每年新增艾滋病毒病例的27.7%，此外，她们未确诊的感染率也很高。然而，据韦特海姆和拉贡内特-克罗宁说，以前从未研究过跨性别妇女的艾滋病毒传播网络。
研究人员发现，洛杉矶县的跨性别女性分布在126个艾滋病毒传播集群中。这些女性很可能彼此聚集在一起(也就是说，至少和一个人有联系变性人女性)，表示有共同的风险活动，比如彼此之间或与共同的伴侣发生性关系。跨性别女性与顺性别男性的联系也比预期的要多。
这种方法使研究人员能够描述伴侣的特征变性妇女在整个县。
“这是关于优先排序的问题有限的资源韦特海姆说。“如果你的目标是改善公共卫生，特别是在服务不足和高危人群中，这些结果为更好地实现这一目标提供了指导。”
现在韦特海姆正在与疾控中心和公众合作健康芝加哥、纽约市和休斯顿的部门采用同样的分子流行病学方法来确定当地艾滋病毒感染风险最高的群体，以及最需要干预和支持的群体。
研究的合著者包括:加州大学圣地亚哥分校的Sheldon R. Morris;胡云银，盛之娟，Kathleen Poortinga，洛杉矶县公共卫生部。
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