新的开源生物信息工具识别负责疾病的因素

波士顿大学医学院（BUSM）的研究人员已经开发并测试了一个新的计算工具，候选人司机分析（CADRA），将搜索可能导致特定疾病的因素的组合。CADRA认识到疾病是复杂的并且可能被多种原因引起的。它现在可以免费获得研究界会员。

测量CaDrA选择基因组特征组的能力，负责某些致癌表现型癌症研究人员基于模拟数据以及来自癌细胞系和原发人类肿瘤的真实基因组数据进行了广泛的评估。他们的模拟结果表明，CaDrA已经高灵敏度对于大中型数据集，高规格?考虑所有样本量的城市。

“我们已经展示了CaDrA在肿瘤细胞系和跨越多种癌症类型的原发肿瘤中正确识别特征明确的驱动突变的能力，以及在人类乳腺癌样本中发现与侵袭性表型相关的新特征的能力，”相应作者Stefano Monti博士解释说。BUSM的医学副教授。

根据研究人员的说法，这个工具可以用来搜索基因和表观遗传变化可能引起恶性肿瘤的兴趣，这样做它可以支持识别新的治疗靶点。

第一作者Vinay Kartha博士补充说:“随着公共可获得的多组学资源的规模和质量不断增加，CaDrA将允许生物医学工作者在寻找导致疾病易感性、药物敏感性和/或途径活性的遗传和表观遗传因素时，灵活地查询这些资源。”他毕业于波士顿大学生物信息学项目，目前是布罗德研究所的博士后研究员

这些发现发表在杂志上遗传学的边疆。

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