2018年12月12日

更快,更便宜的测试可以帮助预测前列腺癌患者的转移风险

新诊断出患有前列腺癌的男性或病人先前治疗,转移的风险是一个重要的决定因素是否选择保守治疗或接受进一步治疗。前列腺癌和其他癌症,原发肿瘤增长或传播是由放大或缺失的部分基因组被称为拷贝数改变(CNAs)。的一篇报道分子诊断的杂志描述了一种新的试验来评估CNAs更便宜,更快,可再生的,需要较少的组织比其他诊断技术和有可能显著提高了前列腺癌的评估。

转移发生在大约16%的前列腺癌,占所有男性的8%癌症人死亡。准确的预测在诊断时可以识别人的风险转移将受益于积极的治疗。检测区域前列腺癌组织或血液可以提供一个指示是否曾经患有疾病进展。放大和删除基因代表新靶点治疗侵略性前列腺癌。

“我们已经证明,必须可以快速而准确地检测到新的下一代拷贝数改变(NG-CNA)测定。这一信息的影响是双重的:保证积极的治疗在诊断时metastasis-prone的男性疾病,并提供一个理由积极监测(而不是过度)无痛性疾病的男性,”首席研究员解释说哈利奥斯塔尔,医学博士,部门的病理学,阿尔伯特•爱因斯坦医学院的布朗克斯,纽约,美国。

NG-CNA试验是针对放大902测序技术能够分析基因组网站属于194基因组区域。相比阵列比较基因组杂交(CGH)数组,NG-CNA更快,可以处理样品每个样品的成本降低。“例如,NG-CNA DNA提取,成本库的准备,和测序试剂可以每样20到40美元,而为全基因组测序近1000美元,”奥斯塔尔博士说。

事实上,“大规模多路复用化验,如NG-CNA分析,提供了一个进入个性化医学应用的一小部分传统的全基因组测序方法的成本,”第一作者添加Viacheslav Fofanov,博士的学校信息,计算和网络系统,旗杆,阿兹,美国北亚利桑那大学。

另一个实际利用NG-CNA是比全基因组测序结果更容易理解。新的试验允许,成千上万的样品处理在一个运行,典型的周转时间为36小时。样品评估NG-CNA化验也比全基因组测序需要更少的数据存储。“这使得我们的方法从大参考实验室小,根据需要更多的资源受限的独立实验室,”奥斯塔尔博士补充说。

NG-CNA试验的进一步的好处是,它可以处理少量的材料(低至12.5 ng)比其他所需的技术,允许细胞系,手术标本,切片进行分析。CNA方法还提供了一个单一平台上其他排序测试,如同伴诊断测试,可以合并。

在以前的工作,研究人员开发了分数的转移潜能(MPS)作为一个指示器的转移潜力,使用数据从其他测量技术。他们发现前列腺癌的议员高度预测,三阴性乳腺癌,肺腺癌转移。在目前的调查,NG-CNA化验数据被用来计算70年议员前列腺癌手术研究样本与已知的临床结果,结果是高度相关的与Oncoscan CNV化验。在一个单独的组,临床发现和分析有效性之间手术活检样本和匹配只在NG-CNA平台上运行。0.99描述的议员阈值从低风险肿瘤风险很高。