如何减缓Ebola-Virologists使用“基因树”来评价干预策略
2013 - 2016年的种系发生树埃博拉疫情不仅揭示埃博拉病毒如何能改进它也揭示了事件和预防措施加速或减缓它的传播。这些发现,研究人员KU Leuvenwere君威研究所发表在自然通讯,打开新的视角控制流行病。
在2013年至2016年之间,非洲西部遭受了有史以来最严重的埃博拉病毒爆发。在几内亚、塞拉利昂和利比里亚,共有29000名患者被诊断出患有这种疾病。超过11000人没有生存。
的流行现在已经过去了,但研究人员想知道干预策略包含疾病是最有效的。1610年的基因数据样本埃博拉患者,研究人员绘制了埃博拉病毒的传播在西非在2013和2016之间。
“我们创造了一个基因家谱的流行,在时间和空间,与几内亚、最古老的DNA样本从2014年初的病毒样本时进入塞拉利昂2014年3月或者4月,教授说,“男人Baele KU鲁汶。
研究者疫情的家谱连接到其他信息,比如地理信息和运输。“长途运输,如航空旅行受污染的人,似乎没有在传播病毒很重要,”来自鲁汶KU博士后研究员Simon Dellicour说道。“与时发生了什么流感疫情由于短途旅行,埃博拉疫情蔓延。加紧步伐一旦流行病毒已经达到科纳克里,弗里敦和Monrovia-the几内亚首都,塞拉利昂和利比里亚。这些国家吸引了病毒,可以这么说,在传播中发挥了关键作用。”
关闭国际边界
研究结果也显示,政策措施可以成功地慢下来,或者相反,加速埃博拉病毒的传播。
“几内亚、塞拉利昂和利比里亚都关闭了他们的国际边界在不同的时刻。这些干预措施在我们可见种系发生树埃博拉病毒,我们也看到病毒如何继续发展。关闭边界是一个有效的方法阻止埃博拉成为国际流行。重要的是要知道,这种类型的干预策略显然有重大的经济和社会后果。一个城市或地区内的预防措施会使小的区别:我们相信,一个协调的方式会有更大的影响。”
持续流行潜力
“这项研究方法给我们提供了一个快速、准确的埃博拉病毒疫情的关键时间和地点,”Baele说。“这告诉我们,当我们应该干预。”
“这些信息对于正在进行的流行也很有用。一方面,我们希望将这种系统推理技术应用到狂犬病,这种疾病在亚洲和非洲每年仍造成60000人死亡。”
更多信息:西蒙Dellicour et al, Phylodynamic评估干预策略的西非埃博拉病毒爆发,自然通讯(2018)。DOI: 10.1038 / s41467 - 018 - 03763 - 2