下一代宏基因组测序技术可能会发现血液中难以发现的病毒

下一代宏基因组测序(NGMS)可能在发现血液中新的病毒感染方面具有广泛的潜力,例如目前常规方法无法发现的人类hepegivirus-1 (HHpgV-1)。HHpgV-1是否会导致人类疾病仍有待观察。研究结果发表在内科学年鉴

人类体内充满了有助于健康和疾病的微生物。NGMS已在临床实践中用于检测未怀疑的病原体,也用于表征已知病毒复杂种群的组成,如HIV-1和丙型肝炎(HCV)。虽然NGMS可以发现新的序列,但检测的极限还没有明确定义。了解NGMS与定量临床标准相比的敏感性和准确性对于确定其临床应用至关重要。

约翰霍普金斯大学医学院的研究人员研究了注射艾滋病病毒和丙肝病毒合并感染药物的患者的血浆样本,这些患者在聚乙二醇干扰素-?2b (IFN)给药及抗逆转录病毒治疗(ART)前后。这一点很重要,因为注射毒品的人血液感染的风险更高,因此可以成为新发感染的“哨兵”.研究人员通过NGMS和定量聚合酶链式反应(PCR)比较了血浆中的病毒核酸。

研究人员发现,NGMS对检测血浆核酸浓度相对较低的病毒不敏感,但能够在人类病毒群中发现一种意想不到的新型肝炎病毒HHpgV-1。此外,研究人员在肝组织中发现了HHpgV-1序列。这一发现的意义尚不清楚,但它揭示了NGMS在检测人体中病毒的敏感性和准确性


进一步探索

外阴、阴道黑素瘤的独特分子特征

更多信息: 内科学年鉴(2017)。http://annals.org/aim/article/doi/10.7326/M17-0085
期刊信息: 内科学年鉴

所提供的美国医师学会
引用:下一代宏基因组测序可能会发现血液中难以发现的病毒(2017年6月5日),检索自2022年5月29日//www.pyrotek-europe.com/news/2017-06-next-generation-metagenomics-sequencing-sleuth-hard-to-find.html
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