研究发现与胆囊癌相关的常见基因变异
通过比较胆囊癌患者和健康志愿者基因组中近70万个不同位置的遗传密码,研究人员说,他们发现了几种可能使个人更易患胆囊癌的基因变异。
该研究结果发表在3月5日的柳叶刀肿瘤学杂志,可以更好地了解这种高度致命疾病的原因,进而可以更好地治疗这种疾病。这项工作是约翰霍普金斯大学彭博公共卫生学院、国家癌症研究所和印度孟买的塔塔纪念癌症中心之间的合作。
虽然胆囊癌症虽然在世界上大多数地区都很罕见,但在某些种族群体中却更为常见,如北美的印第安人,以及某些地理区域,包括中南美洲、东亚和东南亚。全球每年确诊的17.8万例新病例主要集中在这些高风险地区。
“使用最新的技术来研究这种尚未得到充分研究的疾病的原因——尤其是基因基础——是非常有意义的,”该研究的共同领导者Nilanjan Chatterjee博士说,他是彭博学院生物统计系的彭博特约教授,也是约翰霍普金斯大学基梅尔癌症中心的肿瘤学教授
胆囊是腹部的一个小器官,它储存由肝脏产生的消化液——胆汁。如果胆囊癌发现得早,存活的机会就大,但由于胆囊癌通常没有特别的症状,很难诊断,所以发现得晚。
为了寻找哪些基因可能在胆囊癌中起重要作用,塔塔纪念中心的研究人员收集了1042名患者的血液样本,这些患者在2010年9月至2015年6月期间在孟买中心医院接受治疗。在此期间,研究人员还收集了1709名健康志愿者的血液样本,这些志愿者没有已知的癌症,正在医院看望患者。
为了使这些组具有可比性,他们根据年龄、性别和患者来自印度的地理区域进行了匹配。
然后,科学家们对这些血液样本进行了常见单核苷酸多态性(SNPs)的全基因组分析,即不同个体之间的基因组因单核苷酸的变化而不同,单核苷酸是组成基因组的最小单位。
通过一系列的生物统计学和生物信息学分析,他们发现两个基因abcb4和abcb1附近的多个DNA变异具有高度显著的相关性,这两个基因已知与肝脏、胆囊和胆管中的脂质移动有关。此前的一项研究发现ABCB4与胆结石的形成有关,胆结石是胆囊癌的已知危险因素。Chatterjee说,但是新的结果第一次表明,在这个区域常见的遗传变异可能使个体更易患胆囊癌本身,而与胆石状况无关。
研究人员随后复制了这些结果血液样本从447名胆囊癌患者和470名健康的志愿者来自印度北方邦塔塔纪念医院和桑杰·甘地医学科学研究生院。
他们还进行了另一项分析,以估计胆囊癌风险的变化有多少可以用发现的其他常见变异来解释。他们说,他们希望在未来对更大的人群进行类似的研究。
Chatterjee说:“胆囊癌和其他许多癌症和复杂疾病一样,很可能与许多遗传标记有关,每一个都可能有小的影响,但结合起来可以解释风险的巨大变化。”
研究人员估计,多达25%的胆囊癌风险可以用常见的基因变异来解释。虽然目前的研究已经确定的特定遗传变异解释了这种风险的一小部分,但它们与已知的对从肝脏向胆囊运输特定类脂质的重要基因非常接近,这一事实可能为该疾病的起因提供重要线索。
该团队目前正计划对ABCB4/ABCB1区域进行更深入的研究,方法是对当前研究参与者的ABCB4/ABCB1区域进行完全测序,以了解该区域是否存在额外的风险变异。他们还计划进行更大规模的研究,以寻找与胆囊癌相关的其他基因。Chatterjee说,通过更好地了解遗传风险变异的功能,以及通过调查环境和生活方式的原因,研究人员可能最终能够开发出新的治疗方法或干预措施,以防止这种疾病在高危患者中发生。
《常见遗传变异与胆囊癌风险:病例-对照全基因组关联研究》由Sharayu Mhatre、王昭明、Rajini Nagrani、Rajendra Badwe、Shubhada Chiplunkar、Balraj Mittal、S. Yadav、Haoyu Zhang、Charles C. Chung、Prachi Patil、Stephen Chanock、Rajesh Dikshit、Nilanjan Chatterjee和Preetha Rajaraman撰写。
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