新的生物信息学分析揭示了蛋白质在糖尿病肾脏疾病中的作用

加利福尼亚大学圣地亚哥大学医学院研究人员开发的一个新的生物信息学框架已经确定了来自糖尿病肾脏疾病患者的活检组织中基因表达水平的关键蛋白质，这可能揭示了新的治疗靶点。

在最近发表的论文中JCI见解，研究人员，由医学博士Kumar Sharma领导药物在加州大学圣地亚哥分校医学院，透露蛋白质MDM2一直处于下调状态，并在糖尿病肾脏疾病进展。研究人员使用了新的“ Metbridge Generator”生物信息学框架来识别相关的酶和桥接蛋白，这些酶和桥接蛋白将人类代谢组学数据与分子水平上的糖尿病肾脏疾病的病理生理联系起来。

Sharma说：“ Metbridge Generator允许对糖尿病肾脏疾病患者的尿液代谢组数据进行有效的，重点分析，为研究人员提供了基于关键蛋白的细胞或生理作用的新假设的机会。”加州大学圣地亚哥分校医学院代谢组医学研究所和肾翻译医学中心。“该框架也可以用于解释各种疾病的其他代谢组学特征。例如，MDM2还参与调节肿瘤蛋白p53，这是癌症治疗的靶标。”

在先前的研究中，作者确定了13种代谢产物，这些代谢产物在糖尿病肾脏疾病患者中有所改变。研究人员结合了这些信息和代谢途径的公开数据，检验了一个假设，即某些蛋白质充当桥梁创造出较不明确定义的途径。然后，该框架创建了代谢和蛋白质 - 蛋白质相互作用（PPI）网络的地图。这使团队可以更深入地研究相关的桥梁，并与调节糖尿病的13米代谢物特征的酶相互作用最多肾脏疾病。

作者已经确定了蛋白-RNA相互作用作为可能添加到Metbridge Generator网络的其他关键途径的可能来源。这种增长将继续增加疾病治疗的可能治疗靶标。