新的基因组学技术可以提高治疗和控制疟疾
单细胞基因组学提供新的见解疟疾寄生虫的生物学,包括其毒性和耐药性的水平,最终提高疾病的治疗和控制,根据新的研究由威康信托基金会和美国国立卫生研究院。
研究结果显示在德州生物医学研究所的一项研究,发表在《华尔街日报》bob88体育平台登录基因组研究。
疟疾感染通常包含疟原虫的复杂混合物寄生虫导致疾病。这些混合物,即多个基因型感染(MGI),可以改变的影响由于寄生虫感染与彼此竞争,可以驱动耐药性的传播。MGI的非常常见的水平较高的地区疟疾感染但他们生物学是知之甚少。
“70%的感染在撒哈拉以南非洲MGI的,目前我们不知道有多少基因型存在和寄生虫是否来自一个蚊虫叮咬或多个蚊子叮咬”莎莉尼·Nair说,第一作者在纸上。
现有的基因组测序技术涉及样品的化学衰变红细胞从被感染的病人获得寄生虫DNA,然后排序。这个分组排序不能占个人寄生虫在细胞之间的差异。
单细胞基因组允许细胞的分离和隔离提取和个人寄生虫DNA序列,并确定在感染寄生虫之间的任何差异。
“当前测序技术真正限制我们理解疟疾寄生虫生物学”领导这项研究的博士说伊恩•吉斯曼共同成立。“这就像试图理解人类遗传学通过在一个村子里每个人的DNA。数据都是乱七八糟的,但是我们真正想要的是来自个人的信息。”
的团队使用方法单一cell-sorting和全基因组扩增分离单个细胞和放大他们的DNA测序直接从被感染的红细胞。使用单细胞基因组学使测序的个体直接从患者的血液寄生虫。
这项技术允许gis的构成的综合描述,并揭示信息感染和发展的力量耐药性,可以告知疾病控制干预措施。
尽管这项技术目前过于昂贵,要求临床常规使用的,随着技术的成熟应用程序了解疟疾生物学是巨大的。
迈克尔•邓恩博士威康信托基金会的遗传学和分子科学主管说:“疟疾仍然是当今世界最大的杀手之一,尽管几十年的控制工作。深入了解基本疾病的遗传学和整体生物学是有价值的改善未来的干预措施,减少感染和死亡率”。
两种形式的疟疾寄生虫测序的研究;恶性疟原虫(每年造成700000人死亡)间日疟原虫(负责每年2000万感染)。
更多信息:Nair et al。(2014)基因组研究。“解剖复杂的疟疾感染的单细胞基因组学”。www.genome.org/cgi/content/abstract/gr.168286.113