科学家们为疟原虫基因组生成三维结构

科学家们为疟原虫基因组生成三维结构
这张图片显示了人类疟原虫基因组的三维建模在其生命周期的一个阶段。每一种颜色代表一个14的寄生虫基因组染色体,例外是紫色(表明基因被认为与毒性)。信贷:罗氏制药实验室,加州大学河滨分校

领导的一个研究小组在加州大学的细胞生物学家,河畔已生成的3 d模型在三个不同阶段的人类疟原虫基因组等寄生虫的生命循环的第一次生成3 d建筑在寄生虫的生命周期的发展。

导致人类疟疾的寄生虫恶性疟原虫。女性按蚊蚊子传播恶性疟原虫从被感染的人类健康个体,传播疟疾。根据世界卫生组织,2012年估计有2.07亿人感染疟疾,导致627000人死亡。

“了解染色体的空间组织是至关重要的理解在任何真核细胞基因表达的调控,“说Karine罗氏制药,细胞生物学和神经科学副教授,他领导了这一研究。

她的研究小组还发现,那些需要高度表达——例如,基因参与translation-tend集群在同一地区的细胞核,而需要严格抑制了基因,基因virulence-are发现其他三维结构在“镇压中心”。The 3D structure for the malaria parasite显示一个主要镇压中心。

毒力基因在疟疾寄生虫的基因是一个大家庭负责疟原虫的生存在人类。Le罗氏制药的研究小组发现,这些基因,所有组织成一个镇压中心原子核在不同的区域,似乎驱动器的完整基因组组织寄生虫。

研究结果上周在网上出现基因组研究国际同行评审期刊,特点突出原始研究提供新的见解所有生物的基因组生物学。研究报告将显示在打印6月刊的杂志。

“我们成功地映射所有物理寄生虫遗传元素原子核之间的相互作用,”勒罗氏制药说。”为此,我们使用的染色体构象捕获方法,其次是高通量测序技术是最近发展起来的方法来分析组织染色体在细胞的自然状态。然后我们使用地图的所有物理相互作用生成的3 d模型为每个阶段的寄生虫基因组分析了。”

了解生物体的生物学或任何细胞,科学家不仅需要了解基因组序列的信息编码序列是如何压实和身体组织的每一个细胞/组织,以及3 d基因组结构的变化如何发挥重要作用在调节基因表达,染色体形态发生和基因组的稳定性。在人类细胞,染色体组织和压实的变化会导致癌症等疾病。

“如果我们了解疟原虫基因组组织细胞核和哪些组件控制这个组织,我们可以破坏这个架构和破坏,也寄生虫的发展,“Le罗氏制药说。“我们知道,基因架构在调节至关重要,更重要的是,在调节基因寄生虫毒性的关键。现在我们可以更仔细地搜索组件或药物能破坏这个组织,帮助识别的新的抗疟策略。”

Le罗氏制药的实验室现在看着疟疾生命周期的其他阶段为了识别组件负责3 d基因组结构。

“基因组结构的重要性是最初被认为是至关重要的,只有高等真核生物,”她解释道。令我们吃惊的是,“但我们发现基因组结构密切相关的毒性甚至在疟疾寄生虫。”


进一步探索

科学家发现人类疟原虫DNA化学改性

期刊信息: 基因组研究

引用:科学家为疟原虫基因组生成三维结构(2014年4月4日)检索到4 2022年6月从//www.pyrotek-europe.com/news/2014-04-scientists-d-malaria-parasite-genome.html
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