的基因组变异有关系吗?

研究结果发表在科学将加速寻找人类疾病基因。报告提供了第一个全基因组对遗传变异在我们每个人的独特成分导致独特的基因活动模式。

通过定义这些遗传变异生物效应,研究结果将有助于研究的基因组的相应区域的优先次序与疾病。这是一个重要的步骤为个人理解基因和疾病之间的联系,和整个人群。

人类基因组计划给我们构建一个人类的说明书。人类基因组单体型图和拷贝数变异(CNV)项目开发指标手册在哪里找到差异的不同的人。研究变异和疾病的一个挑战是大多数变异对于我们的健康而言没有结果。

这项新研究给出了全局视图的这些差异基因活动的后果。的工作表明,活动影响超过1000个基因序列变异和是第一人口地图标识最重要部分的DNA变异,直接影响基因活性。

这项研究是由来自威康信托基金会桑格研究所的科学家,来自剑桥大学的同事一起,儿童医院/多伦多大学和哈佛医学院/布莱根妇女医院。

利用人类基因组单体型图系列四细胞样本的数量,他们测量了超过14000个基因的活性在细胞生长在文化。细胞样本提供一种细胞中基因活动的快照。每个基因的活动是与遗传变异附近,随着人类基因组单体型图定义的,一个索引的单碱基变化(单核苷酸多态性,或单核苷酸多态性)和拷贝数变异的新索引(CNVs)。

“我们已经能够看回我们的历史,发现变化,年长的和可能之间共享的人口,”博士解释说Manolis Dermitzakis,资深作者和维尔康姆基金会桑格研究所的项目负责人。“但我们也发现许多新的和更少的普遍。

“这些都是我们最近进化的一部分和一个一步了解基因变化的起源和个人的后果,不仅对我们的健康。这是第一代生物重要的DNA序列变异”地图

基因活性的遗传基础的理解将有助于医学研究为个人提供他们的个人信息对疾病的易感性。bob88体育平台登录

这项研究是一项艰巨的任务:它包括人类基因组单体型图700000个snp基因型数据靠近基因,以及25000个站点审问潜在的结构性变化从而检查基因差异,看210年14000个基因的活动无关的个人。

SNP和CNV变化与近900和240个基因的活性改变有关,分别。人类基因组单体型图已经在检测无价的变异参与许多疾病,这些结果表明,CNV指数也会同样有用。

“引人注目的发现是,有小重叠基因发现通过使用两个指标,”马修·赫里斯博士评论道,也是一个领导者维尔康姆基金会桑格研究所的项目。“只有10%的活动与CNV相关变异也关联到一个SNP。

“这意味着我们必须包括CNV的研究在我们的搜索与疾病相关的遗传变异或我们会错过很多重要的遗传效应。”

结果表明,至少有10 - 20%的遗传变异基因活动是由于基因拷贝数异变。研究小组发现关联,包括以前著名的例子,比如UGT2B17基因与前列腺癌有关,证明新方法行之有效。

他们还显示了第一次活动的其他基因,靠近UGT2B17基因的影响。以这种方式发现的其他效应将加强区域内寻找关键基因遗传的可能性。

一些关联在所有四个人群中没有被发现,三分之二(基因拷贝数异变或单核苷酸多态性)仅在一个人群中被发现。基因与显示脊髓性肌萎缩症协会三个人群,但不是在尼日利亚伊巴丹,约鲁巴人。了解人口差异可以帮助我们了解我们的历史。

拷贝数的变化可以影响基因活性通过改变基因的“剂量”,通过扰乱的活跃部分包含编码蛋白质的基因,或通过扰乱监管区域的基因组控制基因活动——在我们的基因开关和调光器开关。

“虽然CNV影响基因活性的简单模型的变体是删除一个基因或一个基因的一部分,我们发现例子活动影响从远处看,“说芭芭拉陌生人,第一作者和维尔康姆基金会桑格研究所的博士后研究员。“这可能发生在当CNV减少地区工作的有效性开关打开或关闭的基因。”

来源:维尔康姆基金会桑格研究所